All arguments are optional; omitted ones fall back to the defaults below.
Pass active = FALSE to turn highlighting off (and reset the palette).
Usage
set_modsem_colors(
positive = "green3",
negative = positive,
true = "green3",
false = "red",
nan = "purple",
na = "purple",
inf = "purple",
string = "cyan",
active = TRUE
)Examples
set_modsem_colors(positive = "red3",
negative = "red3",
true = "darkgreen",
false = "red3",
na = "purple",
string = "darkgreen")
#> [1] TRUE
m1 <- "
# Outer Model
X =~ x1 + x2 + x3
Z =~ z1 + z2 + z3
Y =~ y1 + y2 + y3
# Inner Model
Y ~ X + Z + X:Z
"
est <- modsem(m1, data = oneInt)
colorize_output(summary(est))
#> Estimating baseline model (H0)
#> modsem (version 1.0.25, approach = dblcent):
#>
#> Interaction Model Fit Measures (H1):
#> Loglikelihood -26807.61
#> Akaike (AIC) 53735.22
#> Bayesian (BIC) 54071.28
#> Chi-square 122.92
#> Degrees of Freedom 111
#> P-value (Chi-square) 0.207
#> RMSEA 0.007
#> CFI 1.000
#> SRMR 0.008
#>
#> Fit Measures for Baseline Model (H0):
#> Loglikelihood -27137.74
#> Akaike (AIC) 54393.48
#> Bayesian (BIC) 54723.93
#> Chi-square 783.18
#> Degrees of Freedom 112
#> P-value (Chi-square) 0.000
#> RMSEA 0.055
#> CFI 0.987
#> SRMR 0.141
#>
#> Comparative Fit to H0 (LRT test):
#> Chi-square diff 660.257
#> Degrees of freedom diff 1
#> P-value (LRT) 0.000
#>
#> R-Squared Interaction Model (H1):
#> Y 0.602
#> R-Squared Baseline Model (H0):
#> Y 0.397
#> R-Squared Change (H1 - H0):
#> Y 0.204
#>
#> lavaan 0.6-20 ended normally after 159 iterations
#>
#> Estimator ML
#> Optimization method NLMINB
#> Number of model parameters 60
#>
#> Number of observations 2000
#>
#> Model Test User Model:
#>
#> Test statistic 122.924
#> Degrees of freedom 111
#> P-value (Chi-square) 0.207
#>
#> Parameter Estimates:
#>
#> Standard errors Standard
#> Information Expected
#> Information saturated (h1) model Structured
#>
#> Latent Variables:
#> Estimate Std.Err z-value P(>|z|)
#> X =~
#> x1 1.000
#> x2 0.804 0.013 63.612 0.000
#> x3 0.916 0.014 67.144 0.000
#> Z =~
#> z1 1.000
#> z2 0.812 0.013 64.763 0.000
#> z3 0.882 0.013 67.014 0.000
#> Y =~
#> y1 1.000
#> y2 0.798 0.007 107.428 0.000
#> y3 0.899 0.008 112.453 0.000
#> XZ =~
#> x1z1 1.000
#> x2z1 0.805 0.013 60.636 0.000
#> x3z1 0.877 0.014 62.680 0.000
#> x1z2 0.793 0.013 59.343 0.000
#> x2z2 0.646 0.015 43.672 0.000
#> x3z2 0.706 0.016 44.292 0.000
#> x1z3 0.887 0.014 63.700 0.000
#> x2z3 0.716 0.016 45.645 0.000
#> x3z3 0.781 0.017 45.339 0.000
#>
#> Regressions:
#> Estimate Std.Err z-value P(>|z|)
#> Y ~
#> X 0.675 0.027 25.379 0.000
#> Z 0.561 0.026 21.606 0.000
#> XZ 0.702 0.027 26.360 0.000
#>
#> Covariances:
#> Estimate Std.Err z-value P(>|z|)
#> .x1z1 ~~
#> .x1z2 0.115 0.008 14.802 0.000
#> .x1z3 0.114 0.008 13.947 0.000
#> .x2z1 0.125 0.008 16.095 0.000
#> .x3z1 0.140 0.009 16.135 0.000
#> .x1z2 ~~
#> .x1z3 0.103 0.007 14.675 0.000
#> .x2z2 0.128 0.006 20.850 0.000
#> .x3z2 0.146 0.007 21.243 0.000
#> .x1z3 ~~
#> .x2z3 0.116 0.007 17.818 0.000
#> .x3z3 0.135 0.007 18.335 0.000
#> .x2z1 ~~
#> .x2z2 0.135 0.006 20.905 0.000
#> .x2z3 0.145 0.007 21.145 0.000
#> .x3z1 0.114 0.007 16.058 0.000
#> .x2z2 ~~
#> .x2z3 0.117 0.006 20.419 0.000
#> .x3z2 0.116 0.006 20.586 0.000
#> .x2z3 ~~
#> .x3z3 0.109 0.006 18.059 0.000
#> .x3z1 ~~
#> .x3z2 0.138 0.007 19.331 0.000
#> .x3z3 0.158 0.008 20.269 0.000
#> .x3z2 ~~
#> .x3z3 0.131 0.007 19.958 0.000
#> X ~~
#> Z 0.201 0.024 8.271 0.000
#> XZ 0.016 0.025 0.628 0.530
#> Z ~~
#> XZ 0.062 0.025 2.449 0.014
#>
#> Variances:
#> Estimate Std.Err z-value P(>|z|)
#> .x1 0.160 0.009 17.871 0.000
#> .x2 0.162 0.007 22.969 0.000
#> .x3 0.163 0.008 20.161 0.000
#> .z1 0.168 0.009 18.143 0.000
#> .z2 0.158 0.007 22.264 0.000
#> .z3 0.158 0.008 20.389 0.000
#> .y1 0.159 0.009 17.896 0.000
#> .y2 0.154 0.007 22.640 0.000
#> .y3 0.164 0.008 20.698 0.000
#> .x1z1 0.311 0.014 22.227 0.000
#> .x2z1 0.292 0.011 27.287 0.000
#> .x3z1 0.327 0.012 26.275 0.000
#> .x1z2 0.290 0.011 26.910 0.000
#> .x2z2 0.239 0.008 29.770 0.000
#> .x3z2 0.270 0.009 29.117 0.000
#> .x1z3 0.272 0.012 23.586 0.000
#> .x2z3 0.245 0.009 27.979 0.000
#> .x3z3 0.297 0.011 28.154 0.000
#> X 0.981 0.036 26.895 0.000
#> Z 1.016 0.038 26.856 0.000
#> .Y 0.990 0.038 25.926 0.000
#> XZ 1.045 0.044 24.004 0.000
#>
#>
colorize_output(est) # same as colorize_output(print(est))
#> modsem (version 1.0.25, approach = dblcent):
#> lavaan 0.6-20 ended normally after 159 iterations
#>
#> Estimator ML
#> Optimization method NLMINB
#> Number of model parameters 60
#>
#> Number of observations 2000
#>
#> Model Test User Model:
#>
#> Test statistic 122.924
#> Degrees of freedom 111
#> P-value (Chi-square) 0.207
#>
colorize_output(modsem_inspect(est, what = "coef"))
#> $lambda
#> X Z Y XZ
#> x1 1.000 0.000 0.000 0.000
#> x2 0.804 0.000 0.000 0.000
#> x3 0.916 0.000 0.000 0.000
#> z1 0.000 1.000 0.000 0.000
#> z2 0.000 0.812 0.000 0.000
#> z3 0.000 0.882 0.000 0.000
#> y1 0.000 0.000 1.000 0.000
#> y2 0.000 0.000 0.798 0.000
#> y3 0.000 0.000 0.899 0.000
#> x1z1 0.000 0.000 0.000 1.000
#> x2z1 0.000 0.000 0.000 0.805
#> x3z1 0.000 0.000 0.000 0.877
#> x1z2 0.000 0.000 0.000 0.793
#> x2z2 0.000 0.000 0.000 0.646
#> x3z2 0.000 0.000 0.000 0.706
#> x1z3 0.000 0.000 0.000 0.887
#> x2z3 0.000 0.000 0.000 0.716
#> x3z3 0.000 0.000 0.000 0.781
#>
#> $theta
#> x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3 x1z1 x2z1 x3z1
#> x1 0.160
#> x2 0.000 0.162
#> x3 0.000 0.000 0.163
#> z1 0.000 0.000 0.000 0.168
#> z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.158
#> z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.158
#> y1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.159
#> y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.154
#> y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.164
#> x1z1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.311
#> x2z1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.125 0.292
#> x3z1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.140 0.114 0.327
#> x1z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.115 0.000 0.000
#> x2z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.135 0.000
#> x3z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.138
#> x1z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.114 0.000 0.000
#> x2z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.145 0.000
#> x3z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.158
#> x1z2 x2z2 x3z2 x1z3 x2z3 x3z3
#> x1
#> x2
#> x3
#> z1
#> z2
#> z3
#> y1
#> y2
#> y3
#> x1z1
#> x2z1
#> x3z1
#> x1z2 0.290
#> x2z2 0.128 0.239
#> x3z2 0.146 0.116 0.270
#> x1z3 0.103 0.000 0.000 0.272
#> x2z3 0.000 0.117 0.000 0.116 0.245
#> x3z3 0.000 0.000 0.131 0.135 0.109 0.297
#>
#> $psi
#> X Z Y XZ
#> X 0.981
#> Z 0.201 1.016
#> Y 0.000 0.000 0.990
#> XZ 0.016 0.062 0.000 1.045
#>
#> $beta
#> X Z Y XZ
#> X 0.000 0.000 0 0.000
#> Z 0.000 0.000 0 0.000
#> Y 0.675 0.561 0 0.702
#> XZ 0.000 0.000 0 0.000
#>
#>
# \dontrun{
colorize_output(split = TRUE, {
# Get live (uncolored) output
# And print colored output at the end of execution
est_lms <- modsem(m1, data = oneInt, method = "lms")
summary(est_lms)
})
#>
#> modsem (1.0.25) ended normally after 31 iterations
#>
#> Estimator LMS
#> Optimization method EMA-NLMINB
#> Number of model parameters 31
#>
#> Number of observations 2000
#>
#> Loglikelihood and Information Criteria:
#> Loglikelihood -17493.59
#> Akaike (AIC) 35049.19
#> Bayesian (BIC) 35222.82
#>
#> Numerical Integration:
#> Standard Effective
#> Points of integration (per dim) 24 70
#> Dimensions 1 1
#> Total points of integration 24 70
#>
#> Fit Measures for Baseline Model (H0):
#> Standard
#> Chi-square 17.52
#> Degrees of Freedom (Chi-square) 24
#> P-value (Chi-square) 0.826
#> RMSEA 0.000
#>
#> Loglikelihood -17831.87
#> Akaike (AIC) 35723.75
#> Bayesian (BIC) 35891.78
#>
#> Comparative Fit to H0 (LRT test):
#> Loglikelihood change 338.28
#> Difference test (D) 676.56
#> Degrees of freedom (D) 1
#> P-value (D) 0.000
#>
#> R-Squared Interaction Model (H1):
#> Y 0.599
#> R-Squared Baseline Model (H0):
#> Y 0.395
#> R-Squared Change (H1 - H0):
#> Y 0.204
#>
#> Parameter Estimates:
#> Coefficients unstandardized
#> Information observed
#> Standard errors standard
#>
#> Latent Variables:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> X =~
#> x1 1.000
#> x2 0.803 0.013 63.871 0.000
#> x3 0.914 0.014 67.672 0.000
#> Z =~
#> z1 1.000
#> z2 0.810 0.012 65.057 0.000
#> z3 0.881 0.013 67.575 0.000
#> Y =~
#> y1 1.000
#> y2 0.798 0.007 107.505 0.000
#> y3 0.899 0.008 112.529 0.000
#>
#> Regressions:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> Y ~
#> X 0.673 0.031 21.672 0.000
#> Z 0.569 0.030 18.703 0.000
#> X:Z 0.718 0.028 25.827 0.000
#>
#> Intercepts:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> .x1 1.023 0.024 42.758 0.000
#> .x2 1.215 0.020 60.818 0.000
#> .x3 0.919 0.022 41.356 0.000
#> .z1 1.011 0.024 41.558 0.000
#> .z2 1.206 0.020 59.251 0.000
#> .z3 0.916 0.022 42.046 0.000
#> .y1 1.036 0.033 31.381 0.000
#> .y2 1.220 0.027 45.402 0.000
#> .y3 0.953 0.030 31.785 0.000
#>
#> Covariances:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> X ~~
#> Z 0.200 0.024 8.239 0.000
#>
#> Variances:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> .x1 0.158 0.009 18.135 0.000
#> .x2 0.162 0.007 23.144 0.000
#> .x3 0.165 0.008 20.749 0.000
#> .z1 0.167 0.009 18.495 0.000
#> .z2 0.160 0.007 22.666 0.000
#> .z3 0.158 0.008 20.762 0.000
#> .y1 0.160 0.009 18.005 0.000
#> .y2 0.154 0.007 22.673 0.000
#> .y3 0.164 0.008 20.666 0.000
#> X 0.983 0.036 26.946 0.000
#> Z 1.018 0.038 26.925 0.000
#> .Y 0.980 0.038 25.921 0.000
#>
#>
#> modsem (1.0.25) ended normally after 31 iterations
#>
#> Estimator LMS
#> Optimization method EMA-NLMINB
#> Number of model parameters 31
#>
#> Number of observations 2000
#>
#> Loglikelihood and Information Criteria:
#> Loglikelihood -17493.59
#> Akaike (AIC) 35049.19
#> Bayesian (BIC) 35222.82
#>
#> Numerical Integration:
#> Standard Effective
#> Points of integration (per dim) 24 70
#> Dimensions 1 1
#> Total points of integration 24 70
#>
#> Fit Measures for Baseline Model (H0):
#> Standard
#> Chi-square 17.52
#> Degrees of Freedom (Chi-square) 24
#> P-value (Chi-square) 0.826
#> RMSEA 0.000
#>
#> Loglikelihood -17831.87
#> Akaike (AIC) 35723.75
#> Bayesian (BIC) 35891.78
#>
#> Comparative Fit to H0 (LRT test):
#> Loglikelihood change 338.28
#> Difference test (D) 676.56
#> Degrees of freedom (D) 1
#> P-value (D) 0.000
#>
#> R-Squared Interaction Model (H1):
#> Y 0.599
#> R-Squared Baseline Model (H0):
#> Y 0.395
#> R-Squared Change (H1 - H0):
#> Y 0.204
#>
#> Parameter Estimates:
#> Coefficients unstandardized
#> Information observed
#> Standard errors standard
#>
#> Latent Variables:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> X =~
#> x1 1.000
#> x2 0.803 0.013 63.871 0.000
#> x3 0.914 0.014 67.672 0.000
#> Z =~
#> z1 1.000
#> z2 0.810 0.012 65.057 0.000
#> z3 0.881 0.013 67.575 0.000
#> Y =~
#> y1 1.000
#> y2 0.798 0.007 107.505 0.000
#> y3 0.899 0.008 112.529 0.000
#>
#> Regressions:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> Y ~
#> X 0.673 0.031 21.672 0.000
#> Z 0.569 0.030 18.703 0.000
#> X:Z 0.718 0.028 25.827 0.000
#>
#> Intercepts:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> .x1 1.023 0.024 42.758 0.000
#> .x2 1.215 0.020 60.818 0.000
#> .x3 0.919 0.022 41.356 0.000
#> .z1 1.011 0.024 41.558 0.000
#> .z2 1.206 0.020 59.251 0.000
#> .z3 0.916 0.022 42.046 0.000
#> .y1 1.036 0.033 31.381 0.000
#> .y2 1.220 0.027 45.402 0.000
#> .y3 0.953 0.030 31.785 0.000
#>
#> Covariances:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> X ~~
#> Z 0.200 0.024 8.239 0.000
#>
#> Variances:
#> Estimate Std.Error z.value P(>|z|)
#> .x1 0.158 0.009 18.135 0.000
#> .x2 0.162 0.007 23.144 0.000
#> .x3 0.165 0.008 20.749 0.000
#> .z1 0.167 0.009 18.495 0.000
#> .z2 0.160 0.007 22.666 0.000
#> .z3 0.158 0.008 20.762 0.000
#> .y1 0.160 0.009 18.005 0.000
#> .y2 0.154 0.007 22.673 0.000
#> .y3 0.164 0.008 20.666 0.000
#> X 0.983 0.036 26.946 0.000
#> Z 1.018 0.038 26.925 0.000
#> .Y 0.980 0.038 25.921 0.000
#>
#>
colorize_output(modsem_inspect(est_lms))
#> $N
#> [1] 2000
#>
#> $vcov.all
#> X=~x2 X=~x3 Z=~z2 Z=~z3 Y=~y2 Y=~y3 x1~1 x2~1 x3~1 z1~1 z2~1 z3~1
#> X=~x2 0.000
#> X=~x3 0.000 0.000
#> Z=~z2 0.000 0.000 0.000
#> Z=~z3 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y=~y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y=~y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x1~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> x2~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x3~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z1~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> z2~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z3~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y3~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x1~~x1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x2~~x2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x3~~x3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z1~~z1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z2~~z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z3~~z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1~~y1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2~~y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y3~~y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> X~~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> X~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Z~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~~Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~X:Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1~1 y2~1 y3~1 x1~~x1 x2~~x2 x3~~x3 z1~~z1 z2~~z2 z3~~z3 y1~~y1
#> X=~x2
#> X=~x3
#> Z=~z2
#> Z=~z3
#> Y=~y2
#> Y=~y3
#> x1~1
#> x2~1
#> x3~1
#> z1~1
#> z2~1
#> z3~1
#> y1~1 0.001
#> y2~1 0.001 0.001
#> y3~1 0.001 0.001 0.001
#> x1~~x1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x2~~x2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x3~~x3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z1~~z1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z2~~z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z3~~z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1~~y1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2~~y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y3~~y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> X~~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> X~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Z~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~~Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~X:Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2~~y2 y3~~y3 X~~X X~~Z Z~~Z Y~~Y Y~X Y~Z Y~X:Z
#> X=~x2
#> X=~x3
#> Z=~z2
#> Z=~z3
#> Y=~y2
#> Y=~y3
#> x1~1
#> x2~1
#> x3~1
#> z1~1
#> z2~1
#> z3~1
#> y1~1
#> y2~1
#> y3~1
#> x1~~x1
#> x2~~x2
#> x3~~x3
#> z1~~z1
#> z2~~z2
#> z3~~z3
#> y1~~y1
#> y2~~y2 0.000
#> y3~~y3 0.000 0.000
#> X~~X 0.000 0.000 0.001
#> X~~Z 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Z~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Y~~Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Y~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Y~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Y~X:Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#>
#> $vcov.free
#> X=~x2 X=~x3 Z=~z2 Z=~z3 Y=~y2 Y=~y3 x1~1 x2~1 x3~1 z1~1 z2~1 z3~1
#> X=~x2 0.000
#> X=~x3 0.000 0.000
#> Z=~z2 0.000 0.000 0.000
#> Z=~z3 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y=~y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y=~y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x1~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> x2~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x3~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z1~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> z2~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z3~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y3~1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x1~~x1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x2~~x2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x3~~x3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z1~~z1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z2~~z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z3~~z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1~~y1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2~~y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y3~~y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> X~~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> X~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Z~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~~Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~X:Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1~1 y2~1 y3~1 x1~~x1 x2~~x2 x3~~x3 z1~~z1 z2~~z2 z3~~z3 y1~~y1
#> X=~x2
#> X=~x3
#> Z=~z2
#> Z=~z3
#> Y=~y2
#> Y=~y3
#> x1~1
#> x2~1
#> x3~1
#> z1~1
#> z2~1
#> z3~1
#> y1~1 0.001
#> y2~1 0.001 0.001
#> y3~1 0.001 0.001 0.001
#> x1~~x1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x2~~x2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x3~~x3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z1~~z1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z2~~z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z3~~z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1~~y1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2~~y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y3~~y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> X~~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> X~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Z~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~~Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~X:Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2~~y2 y3~~y3 X~~X X~~Z Z~~Z Y~~Y Y~X Y~Z Y~X:Z
#> X=~x2
#> X=~x3
#> Z=~z2
#> Z=~z3
#> Y=~y2
#> Y=~y3
#> x1~1
#> x2~1
#> x3~1
#> z1~1
#> z2~1
#> z3~1
#> y1~1
#> y2~1
#> y3~1
#> x1~~x1
#> x2~~x2
#> x3~~x3
#> z1~~z1
#> z2~~z2
#> z3~~z3
#> y1~~y1
#> y2~~y2 0.000
#> y3~~y3 0.000 0.000
#> X~~X 0.000 0.000 0.000
#> X~~Z 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Z~~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> Y~~Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Y~X 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Y~Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#> Y~X:Z 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.001
#>
#> $information
#> X=~x2 X=~x3 Z=~z2 Z=~z3 Y=~y2 Y=~y3 x1~1
#> X=~x2 8936.063
#> X=~x3 -2766.571 8142.638
#> Z=~z2 63.767 74.580 9237.096
#> Z=~z3 72.852 81.804 -3031.226 8774.480
#> Y=~y2 -169.905 -194.400 -158.844 -172.314 23797.096
#> Y=~y3 -176.994 -205.515 -169.933 -183.209 -8378.287 20996.450
#> x1~1 32.516 35.878 91.950 97.584 -121.649 -132.023 8008.419
#> x2~1 26.903 28.127 72.085 76.502 -95.368 -103.501 -3633.364
#> x3~1 28.567 32.913 80.785 85.735 -106.877 -115.993 -4071.860
#> z1~1 91.054 99.144 24.235 28.984 -126.473 -133.370 53.857
#> z2~1 77.075 83.922 20.807 24.534 -107.056 -112.894 45.588
#> z3~1 84.554 92.065 22.505 27.209 -117.444 -123.848 50.012
#> y1~1 -23.969 -26.796 -24.065 -28.563 -592.195 -629.884 -175.948
#> y2~1 -19.786 -22.119 -19.865 -23.578 1375.033 -519.950 -145.240
#> y3~1 -21.041 -23.522 -21.125 -25.074 -519.845 1206.760 -154.452
#> x1~~x1 -1389.947 -1476.349 16.813 27.391 -9.209 -10.067 9.993
#> x2~~x2 2732.443 -906.763 25.269 14.873 -6.019 -13.863 -8.372
#> x3~~x3 -1031.735 2748.595 14.420 17.790 14.596 22.362 -7.393
#> z1~~z1 12.672 13.403 -1310.554 -1439.617 14.792 13.963 39.087
#> z2~~z2 33.356 27.747 2862.218 -1037.980 -2.978 0.285 12.944
#> z3~~z3 24.008 33.465 -1120.634 2990.081 -14.401 -17.544 33.884
#> y1~~y1 1.522 1.020 7.099 5.760 -1488.009 -1620.134 3.522
#> y2~~y2 3.406 -5.469 -12.371 -9.414 3076.460 -1163.047 -11.157
#> y3~~y3 -16.431 -12.864 -8.415 -10.835 -1244.583 2872.689 2.006
#> X~~X 1114.457 1246.319 -50.414 -57.283 62.824 66.086 -5.214
#> X~~Z -118.140 -132.884 111.761 130.414 31.862 34.285 -52.111
#> Z~~Z -26.143 -29.548 1158.216 1268.734 49.083 52.207 -16.739
#> Y~~Y -29.420 -42.719 -33.020 -35.367 551.511 591.811 -12.766
#> Y~X -291.148 -315.639 -39.706 -48.443 435.263 458.806 -72.368
#> Y~Z -63.485 -67.765 -275.766 -285.538 397.180 432.683 -418.653
#> Y~X:Z -292.995 -337.420 -317.224 -347.953 418.275 438.007 -75.993
#> x2~1 x3~1 z1~1 z2~1 z3~1 y1~1 y2~1
#> X=~x2
#> X=~x3
#> Z=~z2
#> Z=~z3
#> Y=~y2
#> Y=~y3
#> x1~1
#> x2~1 9487.389
#> x3~1 -3192.184 8576.430
#> z1~1 42.221 47.317 7692.496
#> z2~1 35.739 40.053 -3640.374 9446.348
#> z3~1 39.207 43.939 -3993.594 -3380.475 8930.971
#> y1~1 -137.937 -154.584 -144.381 -122.215 -134.074 7702.686
#> y2~1 -113.863 -127.604 -119.183 -100.885 -110.674 -3983.851 9665.675
#> y3~1 -121.085 -135.698 -126.742 -107.284 -117.693 -4236.535 -3497.131
#> x1~~x1 7.834 8.780 49.424 41.836 45.895 -7.082 -5.846
#> x2~~x2 -6.563 -7.356 12.126 10.264 11.260 4.722 3.898
#> x3~~x3 -5.796 -6.496 31.335 26.524 29.098 5.565 4.594
#> z1~~z1 30.643 34.341 -7.607 -6.439 -7.064 -1.770 -1.461
#> z2~~z2 10.148 11.373 5.858 4.959 5.440 -2.219 -1.831
#> z3~~z3 26.564 29.770 -6.298 -5.331 -5.848 9.377 7.740
#> y1~~y1 2.761 3.094 -4.870 -4.122 -4.522 -0.198 -0.163
#> y2~~y2 -8.747 -9.802 2.646 2.240 2.457 -0.482 -0.398
#> y3~~y3 1.572 1.762 -3.194 -2.704 -2.966 0.157 0.130
#> X~~X -4.088 -4.581 -30.274 -25.626 -28.112 -2.204 -1.819
#> X~~Z -40.853 -45.784 -39.204 -33.185 -36.405 55.739 46.011
#> Z~~Z -13.123 -14.707 7.282 6.164 6.762 -13.179 -10.879
#> Y~~Y -10.008 -11.216 -13.671 -11.572 -12.695 -1.233 -1.018
#> Y~X -56.734 -63.581 -399.050 -337.785 -370.560 -34.442 -28.431
#> Y~Z -328.208 -367.818 -71.576 -60.587 -66.466 -37.672 -31.097
#> Y~X:Z -59.576 -66.766 -51.143 -43.291 -47.491 129.454 106.861
#> y3~1 x1~~x1 x2~~x2 x3~~x3 z1~~z1 z2~~z2 z3~~z3
#> X=~x2
#> X=~x3
#> Z=~z2
#> Z=~z3
#> Y=~y2
#> Y=~y3
#> x1~1
#> x2~1
#> x3~1
#> z1~1
#> z2~1
#> z3~1
#> y1~1
#> y2~1
#> y3~1 8511.184
#> x1~~x1 -6.217 15997.375
#> x2~~x2 4.145 3563.719 22472.558
#> x3~~x3 4.885 4024.024 2487.856 18366.467
#> z1~~z1 -1.554 0.169 12.903 20.640 14793.817
#> z2~~z2 -1.948 53.081 -23.376 24.150 3288.419 22302.790
#> z3~~z3 8.231 14.058 43.412 18.089 3968.110 2885.094 19915.270
#> y1~~y1 -0.174 20.324 10.322 16.769 19.203 20.378 35.817
#> y2~~y2 -0.423 6.672 -18.050 28.905 2.797 10.596 -10.398
#> y3~~y3 0.138 9.051 20.620 -4.925 12.881 -7.001 0.503
#> X~~X -1.934 283.346 175.199 234.685 -8.389 -15.364 -7.478
#> X~~Z 48.929 -22.643 -51.766 -62.316 12.753 13.374 -27.387
#> Z~~Z -11.568 -13.518 5.617 8.448 265.550 188.456 237.171
#> Y~~Y -1.082 88.263 34.250 97.153 85.949 57.423 64.332
#> Y~X -30.234 -169.879 -54.700 -127.828 33.558 -16.921 6.833
#> Y~Z -33.069 -24.555 16.825 2.349 -137.718 -41.301 -144.287
#> Y~X:Z 113.639 -102.912 -97.898 -72.604 -101.340 -117.147 -141.262
#> y1~~y1 y2~~y2 y3~~y3 X~~X X~~Z Z~~Z Y~~Y
#> X=~x2
#> X=~x3
#> Z=~z2
#> Z=~z3
#> Y=~y2
#> Y=~y3
#> x1~1
#> x2~1
#> x3~1
#> z1~1
#> z2~1
#> z3~1
#> y1~1
#> y2~1
#> y3~1
#> x1~~x1
#> x2~~x2
#> x3~~x3
#> z1~~z1
#> z2~~z2
#> z3~~z3
#> y1~~y1 14833.394
#> y2~~y2 3729.685 23354.351
#> y3~~y3 4425.376 3353.661 18111.286
#> X~~X -2.196 0.884 4.971 3650.260
#> X~~Z 0.909 0.407 -1.748 -316.379 1818.438
#> Z~~Z -4.845 4.027 4.499 0.560 44.790 3588.577
#> Y~~Y 171.261 79.637 60.812 9.187 -1.195 8.958 760.433
#> Y~X 18.683 -9.432 11.685 116.714 35.875 -2.338 52.717
#> Y~Z -12.438 42.474 -8.669 10.998 59.715 90.433 48.382
#> Y~X:Z -25.459 15.094 54.451 116.208 54.381 111.249 109.983
#> Y~X Y~Z Y~X:Z
#> X=~x2
#> X=~x3
#> Z=~z2
#> Z=~z3
#> Y=~y2
#> Y=~y3
#> x1~1
#> x2~1
#> x3~1
#> z1~1
#> z2~1
#> z3~1
#> y1~1
#> y2~1
#> y3~1
#> x1~~x1
#> x2~~x2
#> x3~~x3
#> z1~~z1
#> z2~~z2
#> z3~~z3
#> y1~~y1
#> y2~~y2
#> y3~~y3
#> X~~X
#> X~~Z
#> Z~~Z
#> Y~~Y
#> Y~X 1549.633
#> Y~Z 320.376 1596.307
#> Y~X:Z -64.010 -26.389 1510.270
#>
#> $coefficients.all
#> X=~x2 X=~x3 Z=~z2 Z=~z3 Y=~y2 Y=~y3 x1~1 x2~1 x3~1 z1~1 z2~1
#> 0.803 0.914 0.810 0.881 0.798 0.899 1.023 1.215 0.919 1.011 1.206
#> z3~1 y1~1 y2~1 y3~1 x1~~x1 x2~~x2 x3~~x3 z1~~z1 z2~~z2 z3~~z3 y1~~y1
#> 0.916 1.036 1.220 0.953 0.158 0.162 0.165 0.167 0.160 0.158 0.160
#> y2~~y2 y3~~y3 X~~X X~~Z Z~~Z Y~~Y Y~X Y~Z Y~X:Z
#> 0.154 0.164 0.983 0.200 1.018 0.980 0.673 0.569 0.718
#>
#> $coefficients.free
#> X=~x2 X=~x3 Z=~z2 Z=~z3 Y=~y2 Y=~y3 x1~1 x2~1 x3~1 z1~1 z2~1
#> 0.803 0.914 0.810 0.881 0.798 0.899 1.023 1.215 0.919 1.011 1.206
#> z3~1 y1~1 y2~1 y3~1 x1~~x1 x2~~x2 x3~~x3 z1~~z1 z2~~z2 z3~~z3 y1~~y1
#> 0.916 1.036 1.220 0.953 0.158 0.162 0.165 0.167 0.160 0.158 0.160
#> y2~~y2 y3~~y3 X~~X X~~Z Z~~Z Y~~Y Y~X Y~Z Y~X:Z
#> 0.154 0.164 0.983 0.200 1.018 0.980 0.673 0.569 0.718
#>
#> $partable
#> lhs op rhs label group est std.error z.value p.value ci.lower ci.upper
#> 1 X =~ x1 1 1.000 NA NA NA NA NA
#> 2 X =~ x2 1 0.803 0.013 63.871 0 0.779 0.828
#> 3 X =~ x3 1 0.914 0.014 67.672 0 0.887 0.940
#> 4 Z =~ z1 1 1.000 NA NA NA NA NA
#> 5 Z =~ z2 1 0.810 0.012 65.057 0 0.786 0.835
#> 6 Z =~ z3 1 0.881 0.013 67.575 0 0.856 0.907
#> 7 Y =~ y1 1 1.000 NA NA NA NA NA
#> 8 Y =~ y2 1 0.798 0.007 107.505 0 0.784 0.813
#> 9 Y =~ y3 1 0.899 0.008 112.529 0 0.884 0.915
#> 10 Y ~ X 1 0.673 0.031 21.672 0 0.612 0.734
#> 11 Y ~ Z 1 0.569 0.030 18.703 0 0.509 0.628
#> 12 Y ~ X:Z 1 0.718 0.028 25.827 0 0.664 0.773
#> 13 x1 ~1 1 1.023 0.024 42.758 0 0.976 1.070
#> 14 x2 ~1 1 1.215 0.020 60.818 0 1.176 1.255
#> 15 x3 ~1 1 0.919 0.022 41.356 0 0.876 0.963
#> 16 z1 ~1 1 1.011 0.024 41.558 0 0.964 1.059
#> 17 z2 ~1 1 1.206 0.020 59.251 0 1.166 1.245
#> 18 z3 ~1 1 0.916 0.022 42.046 0 0.873 0.958
#> 19 y1 ~1 1 1.036 0.033 31.381 0 0.972 1.101
#> 20 y2 ~1 1 1.220 0.027 45.402 0 1.167 1.272
#> 21 y3 ~1 1 0.953 0.030 31.785 0 0.894 1.012
#> 22 x1 ~~ x1 1 0.158 0.009 18.135 0 0.141 0.175
#> 23 x2 ~~ x2 1 0.162 0.007 23.144 0 0.148 0.176
#> 24 x3 ~~ x3 1 0.165 0.008 20.749 0 0.149 0.180
#> 25 z1 ~~ z1 1 0.167 0.009 18.495 0 0.149 0.184
#> 26 z2 ~~ z2 1 0.160 0.007 22.666 0 0.146 0.173
#> 27 z3 ~~ z3 1 0.158 0.008 20.762 0 0.143 0.173
#> 28 y1 ~~ y1 1 0.160 0.009 18.005 0 0.142 0.177
#> 29 y2 ~~ y2 1 0.154 0.007 22.673 0 0.141 0.168
#> 30 y3 ~~ y3 1 0.164 0.008 20.666 0 0.148 0.179
#> 31 X ~~ X 1 0.983 0.036 26.946 0 0.911 1.054
#> 32 X ~~ Z 1 0.200 0.024 8.239 0 0.153 0.248
#> 33 Z ~~ Z 1 1.018 0.038 26.925 0 0.943 1.092
#> 34 Y ~~ Y 1 0.980 0.038 25.921 0 0.906 1.054
#>
#> $partable.input
#> lhs op rhs group mod
#> 1 X =~ x1 1
#> 2 X =~ x2 1
#> 3 X =~ x3 1
#> 4 Z =~ z1 1
#> 5 Z =~ z2 1
#> 6 Z =~ z3 1
#> 7 Y =~ y1 1
#> 8 Y =~ y2 1
#> 9 Y =~ y3 1
#> 10 Y ~ X 1
#> 11 Y ~ Z 1
#> 12 Y ~ X:Z 1
#>
#> $loglik
#> [1] -17493.59
#>
#> $iterations
#> [1] 31
#>
#> $convergence
#> [1] TRUE
#>
#> $ovs
#> [1] "x1" "x2" "x3" "z1" "z2" "z3" "y1" "y2" "y3"
#>
#> $quadrature
#> $quadrature$adaptive
#> [1] TRUE
#>
#> $quadrature$nodes.per.dim
#> [1] 24
#>
#> $quadrature$dimensions
#> [1] 1
#>
#> $quadrature$nodes.total
#> [1] 24
#>
#> $quadrature$eff.nodes.per.dim
#> [1] 70
#>
#> $quadrature$eff.nodes.total
#> [1] 70
#>
#>
#> $ngroups
#> [1] 1
#>
#> $group
#> NULL
#>
#> $group.label
#> NULL
#>
#> $lambda
#> X Z X:Z Y
#> x1 1.000 0.000 0.000 0.000
#> x2 0.803 0.000 0.000 0.000
#> x3 0.914 0.000 0.000 0.000
#> z1 0.000 1.000 0.000 0.000
#> z2 0.000 0.810 0.000 0.000
#> z3 0.000 0.881 0.000 0.000
#> y1 0.000 0.000 0.000 1.000
#> y2 0.000 0.000 0.000 0.798
#> y3 0.000 0.000 0.000 0.899
#>
#> $theta
#> x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3
#> x1 0.158
#> x2 0.000 0.162
#> x3 0.000 0.000 0.165
#> z1 0.000 0.000 0.000 0.167
#> z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.160
#> z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.158
#> y1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.160
#> y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.154
#> y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.164
#>
#> $wmat
#> X Z X:Z Y
#> x1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x2 0.000 0.000 0.000 0.000
#> x3 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z2 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z3 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y3 0.000 0.000 0.000 0.000
#>
#> $tmat
#> x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3
#> x1 0.000
#> x2 0.000 0.000
#> x3 0.000 0.000 0.000
#> z1 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> z3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> y3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#>
#> $nu
#> ~1
#> x1 1.023
#> x2 1.215
#> x3 0.919
#> z1 1.011
#> z2 1.206
#> z3 0.916
#> y1 1.036
#> y2 1.220
#> y3 0.953
#>
#> $alpha
#> ~1
#> X 0.000
#> Z 0.000
#> X:Z 0.200
#> Y 0.000
#>
#> $beta
#> X Z X:Z Y
#> X 0.000 0.000 0.000 0.673
#> Z 0.000 0.000 0.000 0.569
#> X:Z 0.000 0.000 0.000 0.718
#> Y 0.000 0.000 0.000 0.000
#>
#> $psi
#> X Z X:Z Y
#> X 0.983
#> Z 0.200 1.018
#> X:Z 0.000 0.000 1.040
#> Y 0.000 0.000 0.000 0.980
#>
#> $cov.ov
#> x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3
#> x1 1.141
#> x2 0.789 0.796
#> x3 0.898 0.722 0.985
#> z1 0.200 0.161 0.183 1.184
#> z2 0.162 0.130 0.148 0.825 0.828
#> z3 0.176 0.142 0.161 0.897 0.727 0.948
#> y1 0.775 0.623 0.708 0.713 0.578 0.629 2.603
#> y2 0.619 0.497 0.565 0.570 0.462 0.502 1.951 1.712
#> y3 0.697 0.560 0.637 0.642 0.520 0.565 2.197 1.754 2.139
#>
#> $cov.lv
#> X Z X:Z Y
#> X 0.983
#> Z 0.200 1.018
#> X:Z 0.000 0.000 1.040
#> Y 0.775 0.713 0.747 2.443
#>
#> $cov.all
#> X Z X:Z Y x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2
#> X 0.983
#> Z 0.200 1.018
#> X:Z 0.000 0.000 1.040
#> Y 0.775 0.713 0.747 2.443
#> x1 0.983 0.200 0.000 0.775 1.141
#> x2 0.789 0.161 0.000 0.623 0.789 0.796
#> x3 0.898 0.183 0.000 0.708 0.898 0.722 0.985
#> z1 0.200 1.018 0.000 0.713 0.200 0.161 0.183 1.184
#> z2 0.162 0.825 0.000 0.578 0.162 0.130 0.148 0.825 0.828
#> z3 0.176 0.897 0.000 0.629 0.176 0.142 0.161 0.897 0.727 0.948
#> y1 0.775 0.713 0.747 2.443 0.775 0.623 0.708 0.713 0.578 0.629 2.603
#> y2 0.619 0.570 0.596 1.951 0.619 0.497 0.565 0.570 0.462 0.502 1.951 1.712
#> y3 0.697 0.642 0.672 2.197 0.697 0.560 0.637 0.642 0.520 0.565 2.197 1.754
#> y3
#> X
#> Z
#> X:Z
#> Y
#> x1
#> x2
#> x3
#> z1
#> z2
#> z3
#> y1
#> y2
#> y3 2.139
#>
#> $cor.ov
#> x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3
#> x1 1.000
#> x2 0.828 1.000
#> x3 0.847 0.815 1.000
#> z1 0.172 0.166 0.169 1.000
#> z2 0.167 0.161 0.164 0.833 1.000
#> z3 0.170 0.163 0.167 0.846 0.820 1.000
#> y1 0.450 0.432 0.442 0.406 0.394 0.400 1.000
#> y2 0.443 0.426 0.435 0.400 0.388 0.394 0.924 1.000
#> y3 0.446 0.429 0.439 0.403 0.391 0.397 0.931 0.917 1.000
#>
#> $cor.lv
#> X Z X:Z Y
#> X 1.000
#> Z 0.200 1.000
#> X:Z 0.000 0.000 1.000
#> Y 0.500 0.452 0.469 1.000
#>
#> $cor.all
#> X Z X:Z Y x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2
#> X 1.000
#> Z 0.200 1.000
#> X:Z 0.000 0.000 1.000
#> Y 0.500 0.452 0.469 1.000
#> x1 0.928 0.186 0.000 0.464 1.000
#> x2 0.892 0.179 0.000 0.446 0.828 1.000
#> x3 0.913 0.183 0.000 0.456 0.847 0.815 1.000
#> z1 0.186 0.927 0.000 0.419 0.172 0.166 0.169 1.000
#> z2 0.180 0.898 0.000 0.406 0.167 0.161 0.164 0.833 1.000
#> z3 0.183 0.913 0.000 0.413 0.170 0.163 0.167 0.846 0.820 1.000
#> y1 0.485 0.438 0.454 0.969 0.450 0.432 0.442 0.406 0.394 0.400 1.000
#> y2 0.477 0.432 0.447 0.954 0.443 0.426 0.435 0.400 0.388 0.394 0.924 1.000
#> y3 0.481 0.435 0.450 0.961 0.446 0.429 0.439 0.403 0.391 0.397 0.931 0.917
#> y3
#> X
#> Z
#> X:Z
#> Y
#> x1
#> x2
#> x3
#> z1
#> z2
#> z3
#> y1
#> y2
#> y3 1.000
#>
#> $mean.lv
#> ~1
#> X 0.000
#> Z 0.000
#> X:Z 0.200
#> Y 0.144
#>
#> $mean.ov
#> ~1
#> x1 1.023
#> x2 1.215
#> x3 0.919
#> z1 1.011
#> z2 1.206
#> z3 0.916
#> y1 1.180
#> y2 1.335
#> y3 1.083
#>
#> $mean.all
#> ~1
#> X 0.000
#> Z 0.000
#> X:Z 0.200
#> Y 0.144
#> x1 1.023
#> x2 1.215
#> x3 0.919
#> z1 1.011
#> z2 1.206
#> z3 0.916
#> y1 1.180
#> y2 1.335
#> y3 1.083
#>
#> $r2.all
#> Y x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3
#> 0.599 0.861 0.796 0.833 0.859 0.807 0.833 0.939 0.910 0.924
#>
#> $r2.lv
#> Y
#> 0.599
#>
#> $r2.ov
#> x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3
#> 0.861 0.796 0.833 0.859 0.807 0.833 0.939 0.910 0.924
#>
#> $res.all
#> Y x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3
#> 0.401 0.139 0.204 0.167 0.141 0.193 0.167 0.061 0.090 0.076
#>
#> $res.lv
#> Y
#> 0.401
#>
#> $res.ov
#> x1 x2 x3 z1 z2 z3 y1 y2 y3
#> 0.139 0.204 0.167 0.141 0.193 0.167 0.061 0.090 0.076
#>
#> $iteration.history
#> iteration mode loglik abs.change rel.change elapsed.time
#> 1 1 EM -17493.92 Inf Inf 0.025
#> 2 2 EM -17493.71 2.119961e-01 1.211827e-05 0.035
#> 3 3 EM -17493.67 3.995863e-02 2.284171e-06 0.055
#> 4 4 EM -17493.65 1.338444e-02 7.651022e-07 0.066
#> 5 5 EM -17493.64 9.793522e-03 5.598328e-07 0.076
#> 6 6 EM -17493.59 5.002409e-02 2.859558e-06 0.098
#> 7 7 EM -17493.59 6.007321e-03 3.434011e-07 0.108
#> 8 8 EM -17493.58 4.670163e-03 2.669643e-07 0.118
#> 9 9 EM -17493.63 4.680668e-02 2.675648e-06 0.140
#> 10 10 EM -17493.63 3.368616e-03 1.925624e-07 0.151
#> 11 11 EM -17493.62 2.718920e-03 1.554235e-07 0.161
#> 12 12 EM -17493.62 2.516604e-03 1.438583e-07 0.177
#> 13 13 EM -17493.62 2.172343e-03 1.241792e-07 0.187
#> 14 14 QN -17493.61 9.698486e-03 5.544013e-07 0.215
#> 15 15 EM -17493.61 3.289445e-03 1.880369e-07 0.230
#> 16 16 EM -17493.60 2.365309e-03 1.352099e-07 0.252
#> 17 17 EM -17493.60 1.328041e-03 7.591581e-08 0.262
#> 18 18 EM -17493.60 2.313673e-03 1.322582e-07 0.277
#> 19 19 EM -17493.60 1.769324e-03 1.011412e-07 0.287
#> 20 20 EM -17493.60 1.159928e-03 6.630584e-08 0.297
#> 21 21 EM -17493.60 8.160032e-04 4.664582e-08 0.312
#> 22 22 EM -17493.60 1.296458e-03 7.411042e-08 0.322
#> 23 23 EM -17493.60 8.085805e-04 4.622151e-08 0.332
#> 24 24 EM -17493.59 5.928580e-04 3.389000e-08 0.347
#> 25 25 EM -17493.59 1.737296e-04 9.931041e-09 0.358
#> 26 26 EM -17493.59 9.062088e-05 5.180232e-09 0.368
#> 27 27 QN -17493.59 5.307253e-04 3.033827e-08 0.424
#> 28 28 QN -17493.59 2.602646e-07 1.487771e-11 0.445
#> 29 29 EM -17493.59 2.328088e-07 1.330823e-11 0.456
#> 30 30 FS -17493.59 5.373062e-06 3.071445e-10 0.657
#> 31 31 EM -17493.59 0.000000e+00 0.000000e+00 0.665
#> expected.remaining.iterations expected.final.loglik
#> 1 NA NA
#> 2 NA NA
#> 3 NA NA
#> 4 4 -17493.65
#> 5 5 -17493.64
#> 6 12 -17493.57
#> 7 9 -17493.58
#> 8 8 -17493.58
#> 9 7 -17493.63
#> 10 8 -17493.62
#> 11 8 -17493.62
#> 12 8 -17493.62
#> 13 11 -17493.61
#> 14 20 -17493.60
#> 15 21 -17493.59
#> 16 19 -17493.59
#> 17 38 -17493.58
#> 18 48 -17493.57
#> 19 46 -17493.57
#> 20 29 -17493.58
#> 21 17 -17493.59
#> 22 14 -17493.59
#> 23 10 -17493.59
#> 24 12 -17493.59
#> 25 7 -17493.59
#> 26 0 -17493.59
#> 27 3 -17493.59
#> 28 0 -17493.59
#> 29 0 -17493.59
#> 30 0 -17493.59
#> 31 0 -17493.59
#>
#>
# }